El día 9 de mayo de 2016 el Director del IMEYMAT se reunió en Cádiz junto con el Vicerrector de Investigación de la Universidad de Cádiz, la Delegada del Rector para el Desarrollo Estratégico y el Comisionado del II Plan Estratégico de la UCA (II PEUCA), y los otros directores de Institutos Universitarios de Investigación (ILA y CAIV). La convocatoria (sesión 0) consistió en una reunión informativa sobre la propuesta de que los Institutos elaboren su Plan Director en 2016, y un debate con objeto de consensuar la metodología y el calendario para afrontar el proceso, con los tres directores de los Institutos.
El día 2 de junio de 2016 se celebrará una asamblea común de todas los Comisiones Delegadas de los Consejos de los Institutos para realizar esta tarea (sesión 1), que incluirá una presentación del Vicerrector de Investigación; la asunción de Misión, Visión y Valores de la Universidad; y una reflexión sobre los Objetivos Estratégicos de la UCA, y los objetivos y compromisos firmados por los Institutos. A esta reunión le seguirán otras dos sesiones de trabajo a celebrar entre junio y julio de 2016, en la que el IMEYMAT, junto con el Vicerrectorado de Investigación, deberá elaborar un diagnóstico interno y externo de su situación, los retos del Instituto para los próximos tres años, y una propuesta de actuaciones con su cuadro de seguimiento. Todas estas sesiones serán supervisadas por la Delegación del Rector para II PEUCA, con el objetivo de que se trate de un proceso participativo y asesorado en su metodología.